MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli DH1 chromosome

Total Repeats: 81891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017625	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593591
2	NC_017625	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
3	NC_017625	TAA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386593591
4	NC_017625	GCGGA	2	10	232	241	20 %	0 %	60 %	20 %	386593591
5	NC_017625	TGC	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
6	NC_017625	CCCGGC	2	12	392	403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593591
7	NC_017625	AC	3	6	437	442	50 %	0 %	0 %	50 %	386593591
8	NC_017625	GC	4	8	480	487	0 %	0 %	50 %	50 %	386593591
9	NC_017625	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593591
10	NC_017625	GTT	2	6	533	538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593591
11	NC_017625	GGC	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593591
12	NC_017625	CTG	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
13	NC_017625	GC	3	6	603	608	0 %	0 %	50 %	50 %	386593591
14	NC_017625	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593591
15	NC_017625	CTA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593591
16	NC_017625	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
17	NC_017625	CGA	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
18	NC_017625	T	6	6	747	752	0 %	100 %	0 %	0 %	386593591
19	NC_017625	TAA	2	6	755	760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386593591
20	NC_017625	CTG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
21	NC_017625	GACT	2	8	898	905	25 %	25 %	25 %	25 %	386593591
22	NC_017625	TGA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593591
23	NC_017625	CGA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
24	NC_017625	ACGT	2	8	1027	1034	25 %	25 %	25 %	25 %	386593591
25	NC_017625	TGCCAA	2	12	1064	1075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386593591
26	NC_017625	CGTG	2	8	1106	1113	0 %	25 %	50 %	25 %	386593591
27	NC_017625	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593591
28	NC_017625	TAC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593591
29	NC_017625	GATGGC	2	12	1256	1267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386593591
30	NC_017625	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593591
31	NC_017625	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
32	NC_017625	TGCC	2	8	1349	1356	0 %	25 %	25 %	50 %	386593591
33	NC_017625	AG	3	6	1379	1384	50 %	0 %	50 %	0 %	386593591
34	NC_017625	AGA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593591
35	NC_017625	TTA	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593592
36	NC_017625	ACA	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593592
37	NC_017625	GGT	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593592
38	NC_017625	CTG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593592
39	NC_017625	TGG	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593592
40	NC_017625	CGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593592
41	NC_017625	GC	3	6	1654	1659	0 %	0 %	50 %	50 %	386593592
42	NC_017625	GCG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593592
43	NC_017625	GAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593592
44	NC_017625	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593592
45	NC_017625	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593592
46	NC_017625	ACA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593592
47	NC_017625	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593592
48	NC_017625	CGC	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593592
49	NC_017625	GAA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593592
50	NC_017625	GCTG	2	8	2212	2219	0 %	25 %	50 %	25 %	386593592
51	NC_017625	CG	3	6	2245	2250	0 %	0 %	50 %	50 %	386593592
52	NC_017625	TC	3	6	2256	2261	0 %	50 %	0 %	50 %	386593592
53	NC_017625	CAA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593592
54	NC_017625	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593592
55	NC_017625	ATG	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593592
56	NC_017625	GCCA	2	8	2497	2504	25 %	0 %	25 %	50 %	386593592
57	NC_017625	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593592
58	NC_017625	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593593
59	NC_017625	AGG	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386593593
60	NC_017625	TTTAC	2	10	2904	2913	20 %	60 %	0 %	20 %	386593593
61	NC_017625	CGG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593593
62	NC_017625	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593593
63	NC_017625	AGC	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593593
64	NC_017625	GCG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593593
65	NC_017625	GC	3	6	3113	3118	0 %	0 %	50 %	50 %	386593593
66	NC_017625	GCGG	2	8	3418	3425	0 %	0 %	75 %	25 %	386593593
67	NC_017625	GAT	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593593
68	NC_017625	TGA	3	9	3464	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593593
69	NC_017625	GCT	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593593
70	NC_017625	CTC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386593594
71	NC_017625	GTAT	2	8	3713	3720	25 %	50 %	25 %	0 %	386593594
72	NC_017625	CAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593594
73	NC_017625	GGT	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593594
74	NC_017625	CGA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593594
75	NC_017625	CTCTGT	2	12	3843	3854	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386593594
76	NC_017625	CGG	3	9	3908	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
77	NC_017625	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
78	NC_017625	GTA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593594
79	NC_017625	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	386593594
80	NC_017625	AGA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
81	NC_017625	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
82	NC_017625	CGTT	2	8	4313	4320	0 %	50 %	25 %	25 %	386593594
83	NC_017625	GAACAA	2	12	4329	4340	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386593594
84	NC_017625	TCT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593594
85	NC_017625	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593594
86	NC_017625	CGG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
87	NC_017625	GCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
88	NC_017625	AAG	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
89	NC_017625	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	386593594
90	NC_017625	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386593594
91	NC_017625	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593594
92	NC_017625	CGG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
93	NC_017625	CAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593594
94	NC_017625	GAAC	2	8	4701	4708	50 %	0 %	25 %	25 %	386593594
95	NC_017625	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
96	NC_017625	TGC	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
97	NC_017625	GCG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
98	NC_017625	CG	4	8	4801	4808	0 %	0 %	50 %	50 %	386593594
99	NC_017625	CCG	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593594
100	NC_017625	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593594
101	NC_017625	GGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
102	NC_017625	GC	3	6	5008	5013	0 %	0 %	50 %	50 %	386593594
103	NC_017625	CT	3	6	5026	5031	0 %	50 %	0 %	50 %	386593594
104	NC_017625	CAT	4	12	5118	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593594
105	NC_017625	GCT	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
106	NC_017625	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593594
107	NC_017625	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593594
108	NC_017625	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
109	NC_017625	GAC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593594
110	NC_017625	TGGC	2	8	5366	5373	0 %	25 %	50 %	25 %	386593594
111	NC_017625	CGT	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
112	NC_017625	TATC	2	8	5469	5476	25 %	50 %	0 %	25 %	386593594
113	NC_017625	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593594
114	NC_017625	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
115	NC_017625	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
116	NC_017625	CGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
117	NC_017625	CTGG	2	8	5814	5821	0 %	25 %	50 %	25 %	386593594
118	NC_017625	TCCA	2	8	5845	5852	25 %	25 %	0 %	50 %	386593594
119	NC_017625	GTC	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
120	NC_017625	TGC	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
121	NC_017625	TGC	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
122	NC_017625	GTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593594
123	NC_017625	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593594
124	NC_017625	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
125	NC_017625	TGA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593595
126	NC_017625	GAG	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386593595
127	NC_017625	GGC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593595
128	NC_017625	TGC	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593595
129	NC_017625	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593595
130	NC_017625	TC	3	6	6437	6442	0 %	50 %	0 %	50 %	386593595
131	NC_017625	CAAT	2	8	6467	6474	50 %	25 %	0 %	25 %	386593595
132	NC_017625	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593595
133	NC_017625	CAC	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593595
134	NC_017625	CTG	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593595
135	NC_017625	ATGG	2	8	6837	6844	25 %	25 %	50 %	0 %	386593596
136	NC_017625	CTG	2	6	6852	6857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593596
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147	NC_017625	TGA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593596
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256	NC_017625	GCGG	2	8	13939	13946	0 %	0 %	75 %	25 %	386593603
257	NC_017625	ATC	2	6	13993	13998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593603
258	NC_017625	GCG	2	6	14132	14137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593603
259	NC_017625	CAG	2	6	14236	14241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593603
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261	NC_017625	AAT	2	6	14359	14364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386593603
262	NC_017625	ACCAAT	2	12	14525	14536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386593604
263	NC_017625	CGT	2	6	14589	14594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593604
264	NC_017625	CGAGGT	2	12	14635	14646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386593604
265	NC_017625	TATC	2	8	14647	14654	25 %	50 %	0 %	25 %	386593604
266	NC_017625	GTG	2	6	14681	14686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593604
267	NC_017625	TGA	2	6	14740	14745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593604
268	NC_017625	CAT	2	6	14765	14770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593604
269	NC_017625	TTG	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593604
270	NC_017625	GGC	2	6	14792	14797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593604
271	NC_017625	TGC	2	6	14850	14855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593604
272	NC_017625	GCG	2	6	14856	14861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593604
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276	NC_017625	CCACGC	2	12	15057	15068	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386593604
277	NC_017625	TGA	2	6	15082	15087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593604
278	NC_017625	AATC	2	8	15088	15095	50 %	25 %	0 %	25 %	386593604
279	NC_017625	GAA	2	6	15104	15109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593604
280	NC_017625	AC	3	6	15147	15152	50 %	0 %	0 %	50 %	386593604
281	NC_017625	GCTG	2	8	15212	15219	0 %	25 %	50 %	25 %	386593604
282	NC_017625	CGGAA	2	10	15247	15256	40 %	0 %	40 %	20 %	386593604
283	NC_017625	CGT	2	6	15283	15288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593604
284	NC_017625	CCA	2	6	15310	15315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593604
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286	NC_017625	GCG	2	6	15444	15449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593604
287	NC_017625	GCG	2	6	15567	15572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593604
288	NC_017625	TCT	2	6	15627	15632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593604
289	NC_017625	TGGC	2	8	15647	15654	0 %	25 %	50 %	25 %	386593604
290	NC_017625	TGGA	2	8	15656	15663	25 %	25 %	50 %	0 %	386593604
291	NC_017625	GGC	2	6	15665	15670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593604
292	NC_017625	TGG	2	6	15740	15745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593605
293	NC_017625	T	6	6	15764	15769	0 %	100 %	0 %	0 %	386593605
294	NC_017625	CG	3	6	15773	15778	0 %	0 %	50 %	50 %	386593605
295	NC_017625	TCG	2	6	15892	15897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593605
296	NC_017625	CTT	2	6	15938	15943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593605
297	NC_017625	TCC	2	6	15975	15980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386593605
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302	NC_017625	GGC	2	6	16433	16438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593606
303	NC_017625	CTG	2	6	16544	16549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593606
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332	NC_017625	CAGC	2	8	18275	18282	25 %	0 %	25 %	50 %	386593608
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356	NC_017625	CTGG	2	8	19582	19589	0 %	25 %	50 %	25 %	386593609
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368	NC_017625	ATAGCG	2	12	22747	22758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386593610
369	NC_017625	GAC	2	6	22822	22827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593610
370	NC_017625	GTT	2	6	22882	22887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593610
371	NC_017625	AATT	2	8	22910	22917	50 %	50 %	0 %	0 %	386593610
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373	NC_017625	T	6	6	22943	22948	0 %	100 %	0 %	0 %	386593610
374	NC_017625	ATAA	2	8	22979	22986	75 %	25 %	0 %	0 %	386593610
375	NC_017625	ATT	2	6	23012	23017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593610
376	NC_017625	T	6	6	23016	23021	0 %	100 %	0 %	0 %	386593610
377	NC_017625	TTA	2	6	23038	23043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593610
378	NC_017625	CAT	2	6	23120	23125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593610
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380	NC_017625	TCCA	2	8	23142	23149	25 %	25 %	0 %	50 %	386593610
381	NC_017625	ATA	2	6	23211	23216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386593610
382	NC_017625	TCT	2	6	23317	23322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593610
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384	NC_017625	T	6	6	23445	23450	0 %	100 %	0 %	0 %	386593610
385	NC_017625	CATT	2	8	23473	23480	25 %	50 %	0 %	25 %	386593610
386	NC_017625	GCT	2	6	23684	23689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593611
387	NC_017625	TGG	2	6	23706	23711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593611
388	NC_017625	CAA	2	6	23739	23744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593611
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